農場糞便污水的排放對地表水、地下水、土壤和周圍空氣造成嚴重污染，直接影響人們的健康。未經處理的糞便污水含有大量污染物。如果這種有機廢水直接排入河流、湖泊、水庫或隨雨水沖刷，會消耗水體中大量的溶解氧，使水體發黑發臭，造成水污染。

糞便污水中含有大量氮、磷等營養物質，是水體富營養化的重要原因之一。排放到魚塘和河流中會逐漸殺死對有機污染敏感的水生生物，嚴重時會導致魚塘和河流的使用功能喪失。

養殖污水長期滲入地下，增加了地下水中硝酸鹽氮或亞硝酸鹽氮的濃度，降低了地下水中溶解氧的含量，增加了有毒成分，造成水質惡化，嚴重危害周圍生活用水的水質。

高濃度的污水還會導致土壤孔隙堵塞，導致土壤滲透性和滲透性下降，硬化和鹽漬化，嚴重降低土壤質量，甚至損害作物，導致作物生長受阻或死亡。

豬場排出的污水屬于有機污水，厭氧發酵效果更好，但處理后的污水尚未達到更佳標準，不能直接排放。適量施用于農田和魚塘，是一種優良的營養液。因此，豬場污水處理須從生物學和生態學相結合的角度來考慮，這是促進養殖業相互促進發展的經濟、有效的途徑。

目前國內外對大型豬場糞便的處理方法主要有綜合利用和達標排放處理兩種。綜合利用是生物質能多層次利用，建設生態農業，確保農業與環境和諧共存的可持續發展之路。處理后的達標排放是一個多層次的處理環節。之后，可以在日允許排放濃度范圍內，排放到許多可以使用的地方，如魚塘、農田或果園，從而將環境污染程度降低。